En Japón, ostras de perlas (pintado pintado) son un alimento básico de la acuicultura. Estos preciosos adornos producidos por pequeños irritantes atrapados dentro de los moluscos se utilizan para hacer joyas en todo el mundo. Empresario, agricultor y comerciante Kokichi Mikimoto es ampliamente acreditado con el primer desarrollo de perlas cultivadas hace 130 años y el legado sigue vivo. En 2019, las perlas se negociaron por aproximadamente $5,810 (850,000 yenes) por kilogramo y los precios subieron como mas y mas la gente comenzó a abrazarlos usándolos.
Sin embargo, en los últimos 20 años, una combinación de enfermedades causadas por virus y mareas rojas han afectado muy duramente a la industria de las perlas cultivadas. La producción de las perlas icónicas de Japón cayó de más de 150 000 libras a principios de la década de 1990 a solo 44,092 libras hoy
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Para aprender más sobre la genética de las ostras con la esperanza de descubrir cepas más resistentes, un equipo de investigadores ha construido un genoma de alta calidad a escala cromosómica de una ostra perla. El equipo describe su hallazgo en un estudio publicado ayer en la revista Investigación de ADN
“Es muy importante establecer el genoma”, dijo el autor del estudio Takeshi Takeuchi, científico del personal de la Unidad de Genómica Marina del Instituto de Ciencia y Tecnología de Okinawa (OIST). en una oracion. “Los genomas son el conjunto completo de genes de un organismo, muchos de los cuales son esenciales para la supervivencia. Con la secuencia genética completa, podemos hacer muchos experimentos y responder preguntas sobre la inmunidad y cómo se forman las perlas”.
Este trabajo se remonta a 2012, cuando Takeuchi y sus colaboradores publicó un borrador del genoma de la ostra perla japonesa. Este fue uno de los primeros genomas ensamblados de un molusco, y en los 10 años posteriores, han continuado secuenciando el genoma para encontrar un ensamblaje del genoma a escala cromosómica de mayor calidad.
El genoma de la ostra está compuesto por 14 pares de cromosomas (28 en total), un conjunto heredado de cada padre. Los dos cromosomas de cada par portan genes casi idénticos, pero puede haber diferencias sutiles y un repertorio de genes diverso beneficia su supervivencia.
Normalmente, cuando un Se secuencia el genoma, este par de cromosomas se fusiona. Este proceso funciona bien para los animales en un entorno de laboratorio, ya que normalmente tienen información genética casi idéntica entre el par de cromosomas. Sin embargo, animales salvajes como las ostras, tienen más variantes en los genes que existen entre los pares de cromosomas, y toda esa variación puede conducir a una pérdida de información genética.
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Para este estudio, el equipo secuenció ambos conjuntos de cromosomas en lugar de fusionarlos, posiblemente por primera vez en un invertebrado marino. La secuencia del genoma reconstruyó los 28 cromosomas de las ostras y encontró diferencias clave entre los dos cromosomas de un par: el par de cromosomas 9. Es importante destacar que muchos de los genes presentes en el par de cromosomas 9 estaban relacionados con la inmunidad.
“Diferentes genes en un par de cromosomas es un hallazgo significativo porque las proteínas pueden reconocer diferentes tipos de enfermedades infecciosas”. dijo Takeuchi.
Según Takeuchi, cuando se cultiva el animal, a menudo hay una cepa que tiene una mayor tasa de supervivencia o produce perlas más hermosas. A veces, dos animales con esta cepa pueden criarse juntos, pero eso conduce a la endogamia y reduce diversidad genetica. El estudio encontró que esta importante diversidad genética se redujo significativamente después de tres ciclos de consanguinidad consecutivos.
La inmunidad de las ostras puede verse afectada si la diversidad reducida ocurre en las regiones cromosómicas con genes relacionados con la inmunidad, como el cromosoma 9 en las ostras perleras. “Es importante mantener la diversidad del genoma en las poblaciones acuícolas”, añadido Takeuchi.
Este tipo de investigación ayudará a la industria a prevenir mejor la endogamia para que el sistema inmunológico de las ostras perleras pueda combatir sus crecientes amenazas.