Una empresa que involucró la combinación de cantidades masivas de potencia de procesamiento de gráficos podría proporcionar una influencia clave para los investigadores que buscan desarrollar posibles curas y tratamientos para el nuevo coronavirus detrás de la pandemia global actual. Inicio de inmunoterapia ImmunityBio está trabajando con Azure de Microsoft para entregar una combinación de 24 petaflops de capacidad de computación GPU con el propósito de modelar, en un grado muy alto de detalle, la estructura de la llamada "proteína de pico" que permite que el virus SARS-CoV-2 que causa COVID-19 entrar en las células humanas
Esta nueva asociación significa que fueron capaces de producir un modelo de la proteína espiga en solo unos días, en lugar de los meses que hubiera tomado anteriormente. Ese ahorro de tiempo significa que el modelo puede ponerse en manos virtuales de investigadores y científicos que trabajan en posibles vacunas y tratamientos aún más rápido, y que podrán orientar su trabajo hacia una replicación detallada de la proteína que intentan evitan que se adhiera al receptor de las proteínas ACE-2 humanas, que es lo que configura el proceso de infección viral para comenzar.
La forma principal en que los científicos que trabajan en los tratamientos buscan prevenir o minimizar la propagación del virus dentro del cuerpo es bloquear la unión del virus a estas proteínas, y la forma más sencilla de hacerlo es garantizar que la proteína espiga no pueda conectarse con el receptor al que se dirige. Los anticuerpos naturales en pacientes que se han recuperado del nuevo coronavirus hacen exactamente eso, y las vacunas en desarrollo se centran en hacer lo mismo de forma preventiva, mientras que muchos tratamientos buscan disminuir la capacidad del virus para adherirse a nuevos células a medida que se replica dentro del cuerpo.
En términos prácticos, la asociación entre las dos compañías incluyó un complemento de 1.250 NVIDIA GPU V100 Tensor Core diseñadas para su uso en aplicaciones de aprendizaje automático desde un clúster de Microsoft Azure, trabajando con el clúster de 320 GPU existente de ImmunityBio que está ajustado específicamente para el trabajo de modelado molecular. Los resultados de la colaboración ahora se pondrán a disposición de los investigadores que trabajan en las terapias de mitigación y prevención de COVID-19, con la esperanza de que les permitan trabajar de manera más rápida y efectiva hacia una solución.