Al observar la jungla de microbios que viven dentro de nosotros, los investigadores se han topado con lo que parece ser una clase completamente nueva de objetos similares a virus.
“Es una locura”, dice el biólogo celular de la Universidad de Carolina del Norte, Mark Peifer, que no participó en el estudio. dijo Elizabeth Pennisi en Revista de ciencia. “Cuanto más miramos, más locuras vemos”.
Estos misteriosos fragmentos de material genético no tienen secuencias detectables ni siquiera similitudes estructurales conocidas por otros agentes biológicos.
Por eso, el biólogo Ivan Zheludev de la Universidad de Stanford y sus colegas argumentan que su extraño descubrimiento puede no ser virus en absoluto, sino un grupo completamente nuevo de entidades que pueden ayudar a cerrar la antigua brecha entre las moléculas genéticas más simples y los virus más complejos.
“Los obeliscos comprenden una clase de ARN diversos que han colonizado y pasado desapercibidos en los microbiomas humanos y globales”, afirman los investigadores. escribir en un papel preimpreso.
Las secuencias genéticas de los obeliscos, que reciben su nombre de las estructuras altamente simétricas en forma de varillas formadas por sus longitudes retorcidas de ARN, tienen un tamaño de sólo alrededor de 1.000 caracteres (nucleótidos). De hecho, esta brevedad es probablemente una de las razones por las que no los hemos notado anteriormente.
En un estudio que aún no ha sido revisado por pares, Zheludev y su equipo buscaron en 5,4 millones de conjuntos de datos de secuencias genéticas publicadas e identificaron casi 30.000 obeliscos diferentes. Aparecieron en aproximadamente el 10 por ciento de los microbiomas humanos que examinó el equipo.
En un conjunto de datos, los obeliscos aparecieron en el 50 por ciento de las muestras orales de los pacientes. Es más, diferentes tipos de obeliscos parecen estar presentes en diferentes zonas de nuestro cuerpo.
“[This] apoya la idea de que los obeliscos podrían incluir colonos de dichos microbiomas humanos”, dijeron los investigadores. explicar.
Lograron aislar un tipo de célula huésped de nuestro microbioma, la bacteria sangre de estreptococoss – un microbio común en la boca humana. El Obelisco de estos microbios tenía un bucle de 1.137 nucleótidos de largo.
“Aunque no conocemos los ‘anfitriones’ de otros obeliscos”, escribir Zheludev y colegas. “Es razonable suponer que al menos una fracción puede estar presente en bacterias”.
Dejando a un lado la cuestión del origen de los obeliscos, todos parecen incluir códigos para una nueva clase de proteína que los investigadores han denominado Oblins.
Las instrucciones para construir estas proteínas parecen ocupar al menos la mitad del material genético de los Obeliscos. Como estas proteínas son tan similares en todos los obeliscos, los investigadores sospechan que pueden estar involucradas en el proceso de replicación de la entidad.
Esta capacidad de codificar proteínas los diferencia de otros bucles de ARN conocidos llamados viroides, pero tampoco parecen tener los genes para producir cubiertas de proteínas en las que viven los virus de ARN (incluido el COVID-19) cuando están fuera de las células. .
También son significativamente más grandes que otras moléculas genéticas que coexisten dentro de las células, desde plantas hasta bacterias, llamadas plásmidosque comúnmente están compuestos de ADN.
Sin embargo, Zheludev y su equipo no pudieron identificar ningún impacto de los obeliscos en sus huéspedes bacterianos, ni un medio por el cual pudieran propagarse entre las células.
“Es posible que estos elementos ni siquiera sean de naturaleza ‘viral’ y podrían parecerse más a los ‘plásmidos de ARN'”, dijeron. concluir.
Esta investigación se ha subido al servicio de preimpresión, bioRxiv.